A intensificação das atividades humanas sobre os ecossistemas tem gerado desafios globais, como o aumento da resistência aos antimicrobianos, o crescimento das zoonoses e o surgimento de doenças com potencial pandêmico. A abordagem “Uma Só Saúde” tem se destacado ao reconhecer a interconexão entre a saúde humana, animal e ambiental. A análise da microbiota animal é uma ferramenta valiosa para monitorar esses fenômenos, detectando microrganismos zoonóticos e resistentes aos antimicrobianos, contribuindo para estratégias de conservação ex situ e para a mitigação de riscos à saúde pública e ambiental. O cateto (Pecari tajacu), cuja criação ex situ está em expansão, é um exemplo de mamífero silvestre cuja microbiota e implicações epidemiológicas ainda são pouco conhecidas. Este estudo teve como objetivo avaliar o potencial de catetos mantidos em cativeiros como sentinelas da resistência aos antimicrobianos e de zoonoses negligenciadas. Foram coletados swabs nasais e anais de 70 catetos mantidos no Núcleo de Estudos, Pesquisas e Preservação de Animais Silvestres (NEPPAS/UFPI), além de amostras de sangue para sorologia. Ao todo, foram isoladas e submetidas à identificação por espectrometria de massa por ionização/dessorção de matriz assistida por laser (MALDI-TOF MS) um total de 222 colônias, sendo executada, para uma parcela destas colônias, a confirmação genética de espécies e de genes relacionados aos mecanismos fenotípicos de resistência detectados, empregando-se, para tanto, técnicas de biologia molecular. Identificaram-se 46 espécies, com prevalência das Ordens Enterobacterales e Pseudomonadales, e dos gêneros Staphylococcus e Enterococcus. Perfis de resistência incluíram diferentes espécies do gênero Staphylococcus com resistência a meticilina (MRS) e resistência intermediária à vancomicina (VIS), Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli produtoras de ESBL, Pseudomonas otitidis e Acinetobacter baumannii resistentes às Polimixinas, e Enterococcus resistente à vancomicina (VRE). Sorologias detectaram anticorpos anti-T. gondii e anti-Leptospira spp. Portanto, esses achados indicam o potencial dos catetos mantidos em cativeiro como sentinelas da resistência aos antimicrobianos e de zoonoses negligenciadas. Essa descoberta evidencia o impacto na saúde do ambiente em que vivem, e enfatiza a necessidade de medidas de conservação e monitoramento efetivas para enfrentar os desafios complexos que envolvem a resistência antimicrobiana e de promoção da saúde única.