O uso dos sistemas integrados vem aumentando por ser uma forma de produção mais sustentável e devido aos benefícios proporcionados, como a melhoria na qualidade do solo, aumento da diversidade do ecossistema, e aumento da eficiência de uso dos recursos naturais. Um dos muitos aspectos positivos oriundos da implementação do sistema integrado são as melhorias que ocorrem no solo. Isso melhora a condição química do solo e, por consequência, o desempenho das culturas, permitindo uma melhor produção. O conceito de qualidade do solo está relacionado a capacidade de sustentar a produtividade biológica, manter/melhorar a qualidade ambiental, além de contribuir para a saúde das plantas, dos animais e humana. Os microrganismos, responsáveis pelo funcionamento do solo, atuam nos processos de gênese, decomposição de resíduos orgânicos, ciclagem de nutrientes e formação da matéria orgânica, justificando sua importância como indicadores biológicos nas avaliações de qualidade do solo. Um solo protegido produz mais forragem e mais raízes que, por sua vez, proporcionam estruturação física do solo. Portanto, manter o solo protegido, principalmente, quando em cultivo de grãos, proporciona melhor adaptação das culturas a estreses abióticos, especialmente em regiões com altas temperaturas e solos em processo de construção de fertilidade, como o Cerrado da região Meio-Norte. A partir do momento que há o emprego de técnicas como rotação, sucessão, consorciação e plantio direto há o incremento e melhoria de atributos químicos e a físicos do solo, com forte participação da maior atividade biológica do solo. A atividade biológica mais intensa como o uso de técnicas conservacionistas proporciona a melhoria da sua qualidade. É bom ressaltar que fertilidade e qualidade do solo precisam ser construídas e nunca serão finalizadas. Contudo, atualmente o conceito de se trabalhar amostras de solo “fertbio” têm sido aceita, devido a necessidade de se manejar a fertilidade química e biológica do solo. Dessa forma, a adoção de sistemas integrados apresenta como principal catalisador das alterações que ocorrem no sistema o solo.