Banca de DEFESA: FRANCISCO DE ASSIS DINIZ SOBRINHO
Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.DISCENTE: FRANCISCO DE ASSIS DINIZ SOBRINHO
DATA: 16/01/2019
HORA: 14:00
LOCAL: Auditorio do Núcleo de Pós-Graduação em Ciências Agrárias
TÍTULO: Detecção de loci sob seleção natural em Capra hircus no Brasil
PALAVRAS-CHAVES: Bioinformática, caprinos, genoma, SNPs
PÁGINAS: 70
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Zootecnia
SUBÁREA: Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
RESUMO:
O objetivo do presente trabalho foi buscar loci sob seleção natural (outliers) através de três diferentes abordagens e associar estas regiões do genoma do caprino Marota com possíveis efeitos do processo de adaptação evolutiva, possibilitando a identificação de assinaturas de seleção natural. Foram usadas amostras de 86 caprinos do grupo genético designado Marota, em duas populações. A genotipagem foi realizada utilizando o Chip 50K SNP da Illumina. O estudo identificou um FST global de 0.160 e uma lista de 1761 marcadores outliers que apresentam uma razão FST e Heterozigosidade Esperada Total (HET) acima da zona de neutralidade, com uma média de 0.294625. A análise fdist2 (p-value<0,01) permitiu refinar as distribuições individuais e identificar 14 loci outliers, que indica estarem os mesmos sob efeito de seleção. O pcadapt com FDR<0,01 detectou 14 loci outliers, sendo três com sobreposição nas três abordagens, o que permite caracteriza-los como sob seleção natural. Nessa perspectiva, percebe-se que a determinação da localização e caracterização dos outliers no genoma caprino é fundamental para compreender a função e o envolvimento dessas regiões no processo evolutivo dos grupos genéticos locais ou naturalizados. Conclui-se que os SNPs permitem criar uma robusta fundamentação conceitual e mapas de seleção natural de alta resolubilidade, que facilitarão identificar genes sob seleção e ajuda a elucidar a história evolutiva da Capra hircus no nordeste brasileiro.
MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 012.068.217-60 - ADRIANA MELLO DE ARAÚJO - EMBRAPA
Interno - 1167774 - JOSE ELIVALTO GUIMARAES CAMPELO
Externo ao Programa - 018.422.033-55 - LEONARDO CASTELO BRANCO CARVALHO - UFPI
Externo à Instituição - MIKLOS MAXIMILIANO BAJAY - USP ESALQ