Em galinhas criadas em regiões remotas do Brasil, especificamente da Meio-Norte, espera-se que o nível de diversidade genética seja alto, devido ao isolamento geográfico e seleção natural desde a época da introdução das mesmas no Brasil. Com isso, a pesquisa teve como objetivo identificar medida de diversidade genética de galinhas Gallus gallus domesticus da sub-região Meio-Norte do Brasil, através de marcadores moleculares do tipo microssatélite. Foram coletadas amostras de sangue de 37 aves do núcleo de conservação de recursos genéticos da Embrapa, originárias do Piauí (n = 18) e do Maranhão (n = 19) em FTA cards. O DNA extraído foi amplificado em PCR, e genotipado em sequenciador nos laboratórios da Embrapa - Concórdia-SC. Dos 17 primes avaliados, todos amplificaram. Ao todo, foram identificados 84 alelos nas amostras. O valor médio de heterozigosidade esperada (He) foi de 0,733, e o valor médio de heterozigosidade observada em todos os indivíduos foi de 0,647. Dois dos 17 locus apresentaram desequilíbrio de Hard-Weinberg na população e houve detecção de efeito gargalo pelo modelo IMA que pode indicar o efeito de perdas de variabilidade genética decorrente de processos populacionais não controlados. Diante da pesquisa, conclui-se que dos 17 marcadores microssatélites utilizados, 15 foram bastante informativos para as aves do Meio_Norte do Brasil. Embora os testes estatísticos não tenham detectado diferença entre os grupos de origem geográfica determinados, pode-se verificar maior riqueza alélica e diversidade nas populações do Maranhão, justo por sua localização geográfica e maior isolamento de fluxo gênico por comércio.